โรงเรียนมโนรมย์คริสเตียนมีการประกันคุณภาพการศึกษาผ่านระบบออนไลน์ โดยสํานักงานมาตรฐานและประเมินคุณภาพการศึกษาแห่งชาติ (องค์การมหาชน)
มีการประเมินมาตรฐานทั้ง 3 ระดับการศึกษาปฐมวัยและการศึกษาขั้นพื้นฐาน ดังนี้
- มาตรฐานคุณภาพผู้เรียน
- มาตรฐานของกระบวนการจัดการ
- มาตรฐานของผู้เรียนเป็นศูนย์กลาง
ผลการประเมิน
การศึกษาปฐมวัย:
โรงเรียนได้รับการประเมิน “ดี” ในทุกมาตรฐาน
การศึกษาขั้นพื้นฐาน:
โรงเรียนได้รับการประเมิน “ดีมาก” ในมาตรฐานคุณภาพและการจัดการของผู้เรียนและ “ดี” ในมาตรฐานของผู้เรียนเป็นศูนย์กลาง